2019年10月19日更新
中移動經與鐵總合作，開通了使用一咭兩號內地副號註冊12306的功能。（詳情請見這篇）
由12月27日起，通過12306網站或APP註冊和購票的港人不再需要內地電話號碼。（詳情請看這篇）
2018年10月6日更新
由9月29日起，在12306網站或者App購買了車票的乘客，可以在西九龍站自助取票機取出所有已購買車票，包括非香港出發的車票，無須支付手續費。注意：12306自助取票機只支持內地居民身份證和第二代回鄉證。
另外，由10月1日起，香港的微信支付WeChat Pay HK 支援12306車票支付。相當於，無需內地銀行戶口即可透過WeChat Pay HK使用香港信用卡支付相關款項，支付變得更加便捷。
自從廣深港高鐵開通后，香港聯通內地高鐵網絡。北上神州乘坐高鐵變得更加方便快捷。不過目前香港僅可以無中轉直達44個城市。想要到達別的城市還需要在深圳北或者廣州南中轉內地列車。內地的火車票是無法通過港鐵的售票系統購買，必須使用內地鐵路官方購票網站/App12306，或者前往西九龍站的12306櫃位買票。港人要如何在12306網站註冊用戶呢？港人註冊12306用戶並購票通常要攻克四大難關。
下載12306 app
因為在Google Play沒有中國鐵路12306官方App，Android用戶不得不在12306官方網站掃描二維碼下載App。掃描之後即可下載App的apk格式安裝包。
下載網址：https://kyfw.12306.cn/otn/appDownload/init
對iPhone用戶，App Store有官方12306App可直接下載。
第一個難關：內地電話號碼雙向核驗
第一步：下載App之後，打開App，點擊註冊
第二步：設置用戶名和密碼
第三步：點擊證件類型之後的 中國居民身份證 更改證件類型，點擊 港澳居民來往內地通行證
第四步：填寫個人資料，注意姓名需使用簡體字，證件號碼不需填寫換證次數
第五步：填寫內地手機號嗎和郵箱
（如果沒有內地電話號碼請參閱此文，香港電訊商提供的一咭兩號提供的內地電話號碼不支持註冊，原因請繼續往下看）
註冊用戶完成，但是該用戶還不能購買車票，因為還沒完成最重要的電話號碼雙向核驗。
何謂雙向核驗？就是12306需要驗證你註冊的手機號碼的真確性，不僅僅是直接用該號碼接受驗證碼的單向驗證，而是需要使用該號碼向12306發送SMS才能獲得驗證碼。雙向核驗的操作過程建議在內地進行。
香港電訊商提供的一咭兩號內地手機號無論在香港還是內地發送SMS都以香港號碼的身份發出，所以無法進行核驗。
核驗成功後即可開始買票。
第二個難關：網上付款
現在在12306購買火車票可以使用內地網上銀行和微信支付、支付寶支付。（如何開設內地銀行戶口請看這篇）（如何註冊支付寶請看這篇）
第三個難關：身份核驗
通常用回鄉證註冊的用戶，會顯示「請報驗」。12306官網顯示，「請報驗」常用聯繫人（乘車人）可以辦理網上購票、改簽、變更到站、退票等業務，但購票數量最多為4張（含已改、已退車票）。
所以，計劃行程時，可以提前到車站窗口取票，並且同時為你的回鄉證進行身份核驗。在車站身份核驗過之後會顯示「預通過」，再經過「權威部門」驗證之後，就會顯示「已通過」。通過驗證之後可以添加最多15個聯繫人，為他們購買車票。
第四個難關：取票
西九龍站設有16部12306的自助取票機，如果你的回鄉證是第二代回鄉證，就可以在此取票。如果是第一代回鄉證，就不得不提前在西九龍站的五個12306窗口取票，不過需要支付10至30元的手續費。