皇崗口岸最大的特點一定是通！宵！當夜深人靜，午夜12點之後，來往深圳和香港只剩下一條路，那就是皇崗口岸。
深圳交通接駁：地鐵7號線
以前皇崗口岸深圳方交通接駁不夠完善，去年深圳地鐵7號線開通之後，出關後便是地鐵皇崗口岸站。
從這裡搭地鐵前往歡樂海岸、深圳灣公園和華強路比福田口岸還方便。
如果你想從深圳返回香港亦可以在此站落車，經由人行天橋前往口岸邊檢大樓。
建議前往地點：
華強路
卓越In-town、皇庭廣場、中心城
歡樂海岸、紅樹林
車公廟
香港出發一程過：直通巴士
皇崗口岸的主力交通方式是深港直通巴士，全天24小時服務的有旺角、油尖、灣仔、觀塘和荃灣五條線。而錦上路站和迪士尼、東涌則只有日間有限班次。 從皇崗口岸到油尖只需要五個字，而前往觀塘的乘客則比較多，有時需要等一兩輛巴士才能上到車。
過境穿梭巴士（皇巴士）
直通巴之外最重要的就是皇巴士，是落馬洲黃巴站到皇崗的短途接駁線路。黃巴站可以乘坐九巴76K和17號紅Van來往元朗和上水，九巴276B往上水和天水圍，小巴77往元朗和天水圍。
的士、小巴安排分深宵、白天時段
皇崗口岸的交通比較特別，晚上11點到早上6點半的交通方式同白天還略有不同。
深宵時段的士、小巴獲准進入皇崗口岸港方，無需再轉皇巴士，但在深圳方仍需要搭乘皇巴士。而白天無論的士、小巴都必須通過皇巴士進入管制區。
除了前往屯門、元朗、天水圍的小巴，還有小巴616S前往旺角途徑大埔、沙田、九龍塘。
兩地兩檢較麻煩
皇崗口岸最大的問題是兩地兩檢。無論直通巴還是皇巴士，乘客都需要到達港方管制站後下車過香港關，之後再等車、上車穿過深圳河到達深方口岸下車過內地關，相對深圳灣口岸顯得非常不便。皇崗口岸唯獨勝在直通巴夠直接，無需轉車。所以，若非通宵迫不得已，或者住家接近直通巴車站，不建議由皇崗口岸來往深港。